O Hospital Ernesto Dornelles forma 8 médicos residentes que atuam nas áreas de Cirurgia Geral, Cirurgia Plástica e Coloproctologia. Sendo o primeiro Hospital particular do Estado do RS a desenvolver uma Residência Médica (1962), hoje, é utilizado como modelo em muitos hospitais. Neste período, 564 residentes já passaram pelo HED.
Atualmente, a Residência Médica é composta pelas seguintes áreas: Cirurgia Geral, Cirurgia Plástica, Coloproctologia e Radiologia e Diagnóstico por Imagem, instituída no hospital em 2010.